间接抵免是“直接抵免”的对称。居住国政府对视同本国居民公司间接缴纳的外国所得税所给予的抵免。间接抵免是适用于跨国母子公司之间的税收抵免。

    母子公司之间是一种参股或控股的不同经济实体之间的关系。母子公司分别核算盈亏，分别缴纳税款。作为母公司的投资回报，子公司要按控股比例向母公司支付股息，股息是子公司向其所在国缴纳完所得税后利润的一部分，即属已税所得，母公司所在国要行使居民管辖权征税，自然要把包括收到子公司股息在内的来自各国的所得汇总计征所得税，股息部分因此而发生重复征税。

    但是为了控制抵免范围和防止抵免被滥用，保护母子公司间领导层公司所在居住国的经济利益，许多国家对允许享受间接抵免公司规定了一些严格的限定条件，包括必须拥有其下属外国公司一定比例的股权；必须是其下属公司的积极投资者等。间接抵免按抵免层次不同，可分为一层间接抵免和多层间接抵免。一层间接抵免是指对母公司从其下属的一层附属公司，即子公司取得的股息所承担的外国所得税的抵免。一般来说，多层间接抵免最多不超过三层，超过上述境外三层控股架构的子公司在境外缴纳的所得税税款不得抵免，但石油行业有一些特殊规定。

    母、子、孙、重孙等公司的关系呈现出层层控制的突出特征，股息分配方向是自下而上的。在每一层公司向上一层公司支付的股息中，都含有收到的下一层公司支付的股息部分，也都包含了承担的本层公司和下一层公司的部分所得税额。多层间接抵免的计算原理与一层间接抵免方法基本相同，可以类推，但计算过程和步骤要复杂一些，需要从所涉及的最基层公司向上一层支付的股息所应承担的所得税额算起，逐层往上计算，最后计算出母公司应纳所得税额。