一般来说，这样做不合法，除非是属于暂时性借款、分配利润等特殊情况。
根据《中华人民共和国税收征收管理法》第十七条规定：从事生产、经营的纳税人应当按照国家有关规定，持税务登记证件，在银行或者其他金融机构开立基本存款账户和其他存款账户，并将其全部账号向税务机关报告。

将公司基本户的钱转到老板私人账户上的原因是什么？如果是属于向公司借款：借：其他应收款-老板名
    贷：银行存款
以后拿到发票，证明其用途，可以是采购物资或者其他允许列支的费用，
可冲抵其他应收款。
借：管理费用/营业费用/固定资产/原材料等
   贷：其他应收款
或者老板还款：
借：银行存款/现金
    贷：其他应收款
但如果借款时间超过一年，按税法规定会认为是对老板个人的利润分配，需要就该款项缴纳个人所税。