金碟KIS版中在“生产成本”和“制造费用”科目进行核算，至于如何计算成本，KIS中无相关功能。

如果各个分店独立核算，分店卖出去的东西没有开具发票，可根据销售记录来确认营业收入，来申报纳税；如果由公司统一核算，则可统计各分店收入，交由公司汇总纳税。

根据规定：设有两个以上机构并实行统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送其他机构用于销售，但相关机构设在同一县（市）的除外；所以分店向总店有两种处理方法：一是视同销售，领货时分店：借，库存商品或（原材料），贷，应付账款。总店：借，应收账款，贷，主营收入

二是如果总店与分店在同一市县，那么公司配送给各门店的商品，可作为内部移库处理。